Il laboratorio analisi è sempre stato la punta di forza di Progetto Alimenti, in quanto specializzato  su  tutte le matrici alimentari con metodiche validate secondo standard internazionali.

Vengono effettuate analisi su alimenti, acque potabili e minerali. Indagini cognitive sulle superfici, controllo della qualità dell’aria ed ambienti di lavoro. Controllo di prodotti cosmetici.

Vengono inoltre effettuate prove di shelf-life (durata commerciale prodotto) per la valutazione dei tempi di scadenza dei prodotti.

Il laboratorio è ad oggi inserito nell’elenco della Regione Toscana al numero 11 come struttura abilitata alle analisi in sede di autocontrollo per le industrie alimentari con Decreto Dirigenziale n°1859 del 19.04.2007